常菌群的生理作用包括：

　　1.幫助消化：常菌群在腸道內分解食物，產生益生菌和酸性物質，維持腸道內環境的酸堿平衡和消化道菌群的穩定。

　　2.促進免疫系統發揮作用：常菌群通過調節免疫系統的功能，提高免疫力，幫助預防一些疾病。

　　3.維持腸道屏障：常菌群在腸道內形成一層保護屏障，防止有害菌、毒素進入人體，保護腸道黏膜的健康。

　　4.合成維生素：常菌群合成一些人體不能自行合成的維生素（如維生素K和B族維生素），維持人體正常的生理功能。

　　不包括的生理作用是：通過常菌群的作用，調節人體代謝，控制血糖和膽固醇水平，預防心血管疾病等。