寶寶在出生后的頭幾天內，腸道中將會出現細菌。這些細菌主要來自于母親的產道、乳汁以及周圍環境中的微生物。初生嬰兒的腸道中的細菌群落會逐漸發展，并在幾個月內趨于穩定。初生嬰兒的腸道細菌群落的構成與嬰兒的喂養方式、環境暴露等因素有關，這對嬰兒的免疫系統發育和整體健康發展非常重要。