腸道中最多的菌種是乳酸桿菌（Lactobacillus）。這是一類常見的益生菌，主要存在于人類和動物的消化道中。乳酸桿菌具有很強的耐酸能力和抗菌能力，在腸道中起到維持菌群平衡、抑制有害菌生長和增強免疫力等重要作用。除乳酸桿菌外，腸道中還存在其他多種菌種，如雙歧桿菌（Bifidobacterium）、鏈球菌（Enterococcus）等。這些菌種共同構成了腸道菌群，對人體的健康起著重要影響。